กฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการในกระทรวงสาธารณสุข ประกาศในพระราชกิจจานุเบกษา วันที่ 28 ธันวาคม 2552 เปลี่ยนชื่อ กองสุขาภิบาลชุมชนและประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ เป็น “กองประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ” โดยมีบทบาทภารกิจดังนี้
1. ศึกษา วิจัย พัฒนาและประยุกต์ องค์ความรู้และเทคโนโลยีด้านการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ และการเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อม
2. พัฒนาระบบ กลไก และรูปแบบการดำเนินการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ เพื่อส่งเสริมและสนับสนุนให้มีการดำเนินงานให้เป็นไปตามกฎหมายที่เกี่ยวข้อง รวมทั้งพัฒนาระบบและรูปแบบการเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อม
3. ถ่ายทอดและพัฒนาศักยภาพ ขีดความสามารถ ให้คำปรึกษา ข้อเสนอแนะ ประสานงานร่วมมือกับภาคีเครือข่ายภาครัฐ เอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น ในการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพและการเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อม รวมทั้งพัฒนาความร่วมมือระหว่างประเทศในการแลกเปลี่ยนเรียนรู้ และถ่ายทอดเทคโนโลยีด้านการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ
4. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย
1) การพัฒนาองค์ความรู้ นวัตกรรม เกณฑ์ มาตรฐาน เครื่องมือ รูปแบบ แนวทางปฏิบัติด้านการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ การเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อม และการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศด้านสุขภาพ ที่เหมาะสมกับบริบทของประเทศไทย
2) การส่งเสริมและสนับสนุนให้หน่วยงานหรือองค์กรที่เกี่ยวข้องได้นำการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ และการเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อมไปใช้ในการจัดการ ป้องกัน และแก้ไขปัญหามลพิษสิ่งแวดล้อมที่อาจจะมีผลกระทบต่อสุขภาพ รวมทั้ง และการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศด้านสุขภาพ
3) การส่งเสริมและสนับสนุนการมีส่วนร่วมของภาคีเครือข่าย ทั้งในประเทศ และระหว่างประเทศ เพื่อสนับสนุนการพัฒนา และดำเนินงานด้านการประเมินผลกระทบต่อสุขภาพ และเฝ้าระวังด้านอนามัยสิ่งแวดล้อม รวมทั้งการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศด้านสุขภาพของประเทศไทย
4) การสร้างความเข้มแข็งของบุคลากรและองค์กรให้มีศักยภาพ มีความเข้มแข็ง มีความพร้อมในการปฏิบัติงาน รวมถึงการคาดการณ์ปัญหาที่อาจเกิดขึ้นในอนาคต